WARNING: Your browser seems not able to hande javascript .
|
|
Home
Files
Credits
Command builder
Build your set of commands to run Merlin...
command-builder
--Input Files and Basic Parameters--
-d
-p
-x
-m
-f
-fa
-fm
-ff
-fe
-r
--General Analyses--
--error
--information
--likelihood
--model
--IBD State Calculations--
--ibd
--kinship
--select
--Non-Parametric Linkage Analyses--
--npl
--pairs
--qtl
--deviates
--exp
--zscores
--Variance Components Linkage Analysis--
--vc
--useCovariates
--ascertainment
--unlinked
--Association Analyses--
--infer
--assoc
--fastAssoc
--filter
--custom
--Analysis Positions--
--steps
--minStep
--maxStep
--grid
--start
--stop
--positions
--Haplotyping Analyses--
--best
--sample
--all
--founders
--horizontal
--Recombination Options--
--zero
--one
--two
--three
--singlepoint
--Marker Clustering Options for Modelling Linkage Disequilibrium--
--cluster
--distance
--rsq
--cfreq
--Resource Usage--
--bits
--megabytes
--minutes
--Performance--
--trim
--noCoupleBits
--swap
--smallSwap
--Output Formatting--
--quiet
--markerNames
--frequencies
--perFamily
--pdf
--tabulate
--prefix
--Simulation Options--
--simulate
--reruns
--save
--trait_QTLNAME,SNP,Var(QTL),Var(Polygenes),Var(Environment)
Submit
Comment
Reset line
Reset all
Save all
Launch Merlin
list of saved commands
comment of the parameter
| 
|